Оснат Зомер-Пенн
Оснат Зомер-Пенн (англ. Osnat Penn) — израильский вычислительный биолог[1].
Биография[править]
Работает в Тель-Авивском университете и в Сиэтлском университете в Вашингтоне. Занимается изучением последовательности генома, отобранного среди сотен детей-аутистов, и сравнивая эти последовательности с геномами их здоровых родителей. Цель этих работ заключается в том, чтобы вычислить комбинацию, которая сможет объяснить появления аутизма, и разработать генную терапию этого заболевания.
Также она ответственна за работу нескольких компьютерных программ, разработанных в Тель-Авивском университете для того, чтобы помочь в биологических исследованиях.
В 2013 году получила премию Л’Ореаль — ЮНЕСКО «Для женщин в науке» за исследования в области генетической основы аутизма.
Труды[править]
- Penn, Osnat; Privman, Eyal; Ashkenazy, Haim; Landan, Giddy; Graur, Dan; Pupko, Tal. "GUIDANCE: a web server for assessing alignment confidence scores". Nucleic Acids Research 38 (suppl 2): W23–W28.
- Penn, Osnat; Stern, Adi; Rubinstein, Nimrod D.; Dutheil, Julien; Bacharach, Eran; Galtier, Nicolas; Pupko, Tal. "Evolutionary Modeling of Rate Shifts Reveals Specificity Determinants in HIV-1 Subtypes". PLoS Comput Biol 4 (11): e1000214.
- Bernier, Raphael; Golzio, Christelle; Xiong, Bo; Stessman, Holly A.; Coe, Bradley P.; Penn, Osnat; Witherspoon, Kali; Gerdts, Jennifer; Baker, Carl. "Disruptive CHD8 Mutations Define a Subtype of Autism Early in Development". Cell 158 (2): 263–276.
- Gelfman, Sahar; Burstein, David; Penn, Osnat; Savchenko, Anna; Amit, Maayan; Schwartz, Schraga; Pupko, Tal; Ast, Gil. "Changes in exon–intron structure during vertebrate evolution affect the splicing pattern of exons". Genome Research 22 (1): 35–50.
- Privman, Eyal; Penn, Osnat; Pupko, Tal. "Improving the Performance of Positive Selection Inference by Filtering Unreliable Alignment Regions". Molecular Biology and Evolution 29 (1): 1–5.
- Stern, Adi; Mayrose, Itay; Penn, Osnat; Shaul, Shaul; Gophna, Uri; Pupko, Tal. "An Evolutionary Analysis of Lateral Gene Transfer in Thymidylate Synthase Enzymes". Systematic Biology 59 (2): 212–225.
- Blanga-Kanfi, Shani; Miranda, Hector; Penn, Osnat; Pupko, Tal; DeBry, Ronald W.; Huchon, Dorothée. "Rodent phylogeny revised: analysis of six nuclear genes from all major rodent clades". BMC Evolutionary Biology 9 (1): 71.
- Mayrose, Itay; Penn, Osnat; Erez, Elana; Rubinstein, Nimrod D.; Shlomi, Tomer; Freund, Natalia Tarnovitski; Bublil, Erez M.; Ruppin, Eytan; Sharan, Roded. "Pepitope: epitope mapping from affinity-selected peptides". Bioinformatics 23 (23): 3244–3246.
- Bublil, Erez M.; Freund, Natalia Tarnovitski; Mayrose, Itay; Penn, Osnat; Roitburd-Berman, Anna; Rubinstein, Nimrod D.; Pupko, Tal; Gershoni, Jonathan M. "Stepwise prediction of conformational discontinuous B-cell epitopes using the Mapitope algorithm". Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics 68 (1): 294–304.