Чотиа, Сайрус

Материал из Циклопедии
(перенаправлено с «Cyrus Chothia»)
Перейти к навигации Перейти к поиску

Чотиа, Сайрус

Научный деятель














Сайрус Хоми Чотиа (англ.Cyrus Homi Chothia; 19 февраля 1942 года — 26 ноября 2019 года)[1] — английский биохимик. Член Королевского общества[2][3], почётный сотрудник Лаборатории молекулярной биологии (LMB) Совета медицинских исследований (MRC) при Кембриджском университете[4][5] и почётный научный сотрудник Вольфсон-колледжа в Кембридже[2][6][7][8][9][10][11].

Образование[править]

Сайрус Чотия учился в школе Аллейна[12].

В 1965 году получил степень бакалавра Даремского университета[1] .

В 1967 году — степень магистра в Биркбек-колледже Birkbeck College и докторскую степень в Университетском колледже Лондона[13] под руководством Питера Полинга[14], сына Лайнуса Полинга.

Исследования и карьера[править]

После получения докторской степени Чотия три года работал в Лаборатории молекулярной биологии (LMB).

Затем он сотрудничал с Майклом Левиттом [15] в Институте Вейцмана[16][17], затем с Джоэлем Жаненом в Институте Пастера в Париже[18].

В 1976 году Чотия вернулся в Англию, чтобы работать в Университетском колледже Лондона и LMB. Совместно с Артуром Леском[19][20] он доказал, что белки адаптируются к мутациям путём изменения структуры.

В 1992 году он предположил, что большинство белков построены из доменов, принадлежащих небольшому числу семейств[21]. Он сотрудничал с Алексеем Мурзиным, Стивеном Бреннером и Тимом Хаббардом для создания базы данных структурной классификации белков (SCOP)[22][23], периодической таблицы для всех известных белковых структур. Совместно с Джулианом Гофом[24] он создал базу данных Superfamily[25], которая использует скрытые модели Маркова для идентификации последовательностей белков, родственных последовательностям известных структур.

За свою карьеру Чотия руководил 19 успешными аспирантами[26], включая Алекса Бейтмана[27], Стивена Э. Бреннера[28], Марка Бендера Герштейна[29], Джулиана Гофа[30], Сары Тейхманн[31], Биссан Аль-Лазикани[32][33][34], Гога Апик[35], Саманта Барре[36], Мэтью Баштон[37][38][39][40], Дэн Болсер[41], Майкл Бреманг[42], Бернар де Боно[43][44], Эмма Гэнли (Хилл)[45][46][47], Мартин Мадера[48][49], Siarhei Maslau[50], Сьюзен Миллер[51][52][53], Чон Пак (Чон Бхак)[54][55][56], Раджкумар Сасидхаран[57][58] и Кристин Фогель[59][60].

Награды и почётное членство[править]

В 2000 году Сайрус Чотия был избран членом Королевского общества (FRS)[1]. В его свидетельстве об избрании написано:

Доктор Чотиа показал, как аминокислотные последовательности белков определяют их структуру, функции и эволюцию. На основе анализа закономерностей их строения он разработал общепринятую в настоящее время классификацию белковых структур. Его картина эволюции белков предполагает, как белки расходятся и приобретают новые функции. Он помог нам понять, как ограниченный набор слегка отличающихся структур позволяет иммуноглобину распознавать почти безграничное разнообразие различных антигенов.

В 2015 году Чотия был избран членом Международного общества вычислительной биологии (ISCB)[61] и был удостоен премии ISCB для старших научных сотрудников за использование вычислительных методов для понимания структуры белка[62][63].

Вместе с Дэвидом Хаусслером и Майклом Уотерманом удостоен премии Дэна Дэвида 2015 года за вклад в область биоинформатики[64].

Примечания[править]

Шаблон:Scholia

  1. ↑ 1,0 1,1 1,2 Шаблон:Who's Who
  2. ↑ 2,0 2,1 Wolfson College: Emeritus Fellow Dr Cyrus Chothia MA MSc FRS. Архивировано из первоисточника 5 февраля 2012.
  3. ↑ Cyrus Chothia (1942–2019) (27 November 2019). Проверено 27 ноября 2019.
  4. ↑ Cyrus Chothia: The protein origins of biological complexity, LMB Emeritus. Архивировано из первоисточника 15 февраля 2012.
  5. ↑ Structural genomics and protein structure. Mrc-lmb.cam.ac.uk. Архивировано из первоисточника 14 февраля 2015. Проверено 24 июня 2014.
  6. ↑ Шаблон:DBLP
  7. ↑ cyrus chothia. Google Scholar. Проверено 24 июня 2014.
  8. ↑ (1989) «Conformations of immunoglobulin hypervariable regions». Nature 342 (6252): 877–883. DOI:10.1038/342877a0. PMID 2687698. Bibcode: 1989Natur.342..877C.
  9. ↑ (2015) «Genome3D: Exploiting structure to help users understand their sequences». Nucleic Acids Research 43 (Database issue): D382–6. DOI:10.1093/nar/gku973. PMID 25348407.
  10. ↑ (2003) «Evolution of the protein repertoire». Science 300 (5626): 1701–3. DOI:10.1126/science.1085371. PMID 12805536. Bibcode: 2003Sci...300.1701C.
  11. ↑ Шаблон:Scopus
  12. ↑ Dan David Prize Awarded to Dr Cyrus Chothia. Alleyn's School. Архивировано из первоисточника 23 марта 2015.
  13. ↑ Chothia, Cyrus (1973), «The crystal structures of some molecules active at cholinergic nerve receptors», University College London, Шаблон:ProQuest, OCLC 926297115 
  14. ↑ (1969) «On the conformations of hallucinogenic molecules and their correlation». Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 63 (4): 1063–1070. DOI:10.1073/pnas.63.4.1063. PMID 4311249. Bibcode: 1969PNAS...63.1063C.
  15. ↑ Cyrus H. Chothia, Chemistry Tree. Архивировано из первоисточника 27 февраля 2015.
  16. ↑ (1977) «Structure of proteins: Packing of alpha-helices and pleated sheets». Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 74 (10): 4130–4134. DOI:10.1073/pnas.74.10.4130. PMID 270659. Bibcode: 1977PNAS...74.4130C.
  17. ↑ (1976) «Structural patterns in globular proteins». Nature 261 (5561): 552–558. DOI:10.1038/261552a0. PMID 934293. Bibcode: 1976Natur.261..552L.
  18. ↑ (1974) «Crystal structure of the complex of porcine trypsin with soybean trypsin inhibitor (Kunitz) at 2.6-A resolution». Biochemistry 13 (20): 4212–4228. DOI:10.1021/bi00717a024. PMID 4472048.
  19. ↑ (1980) «How different amino acid sequences determine similar protein structures: The structure and evolutionary dynamics of the globins». Journal of Molecular Biology 136 (3): 225–270. DOI:10.1016/0022-2836(80)90373-3. PMID 7373651.
  20. ↑ (1980) «Solvent accessibility, protein surfaces, and protein folding». Biophysical Journal 32 (1): 35–47. DOI:10.1016/S0006-3495(80)84914-9. PMID 7248454. Bibcode: 1980BpJ....32...35L.
  21. ↑ (1992) «One thousand families for the molecular biologist». Nature 357 (6379): 543–4. DOI:10.1038/357543a0. PMID 1608464. Bibcode: 1992Natur.357..543C.
  22. ↑ (1997) «SCOP: A structural classification of proteins database». Nucleic Acids Research 25 (1): 236–239. DOI:10.1093/nar/25.1.236. PMID 9016544.
  23. ↑ UK government grants awarded to Cyrus Chothia. Research Councils UK. Архивировано из первоисточника 15 октября 2014.
  24. ↑ Ошибка цитирования Неверный тег <ref>; для сносок gough не указан текст
  25. ↑ (2002) «SUPERFAMILY: HMMs representing all proteins of known structure. SCOP sequence searches, alignments and genome assignments». Nucleic Acids Research 30 (1): 268–272. DOI:10.1093/nar/30.1.268. PMID 11752312.
  26. ↑ Alex Bateman Cyrus Chothia's academic family tree. twitter (2015). Архивировано из первоисточника 15 июля 2015.
  27. ↑ Ошибка цитирования Неверный тег <ref>; для сносок batemanphd не указан текст
  28. ↑ Ошибка цитирования Неверный тег <ref>; для сносок brennerphd не указан текст
  29. ↑ Ошибка цитирования Неверный тег <ref>; для сносок gersteinphd не указан текст
  30. ↑ Ошибка цитирования Неверный тег <ref>; для сносок goughphd не указан текст
  31. ↑ Ошибка цитирования Неверный тег <ref>; для сносок teichmannphd не указан текст
  32. ↑ Al-Lazikani, Bissan (1999), «Canonical structures of immunoglobulins and T cell receptors», University of Cambridge, <http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.624098> 
  33. ↑ Dr Bissan Al-Lazikani Team leader. The Institute of Cancer Research. Архивировано из первоисточника 5 марта 2015.
  34. ↑ (2000) «Canonical structures for the hypervariable regions of T cell alphabeta receptors». Journal of Molecular Biology 295 (4): 979–95. DOI:10.1006/jmbi.1999.3358. PMID 10656805.
  35. ↑ Apic, Gordana (2003), «Evolution of multidomain proteins in genomes», University of Cambridge, Шаблон:EThOS, OCLC 894594841, <http://idiscover.lib.cam.ac.uk/primo-explore/fulldisplay?docid=44CAM_ALMA21433441040003606&context=L&vid=44CAM_PROD&search_scope=SCOP_CAM_ALL&tab=cam_lib_coll&lang=en_US> 
  36. ↑ (1994) «Structural conservation of hypervariable regions in immunoglobulins evolution». Nature Structural Biology 1 (12): 915–920. DOI:10.1038/nsb1294-915. PMID 7773781.
  37. ↑ Bashton, Matthew (2004), «Functional analysis of domain combinations», University of Cambridge, <http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.616149> 
  38. ↑ Dr Matthew Bashton: Research Associate: INSTINCT project. Архивировано из первоисточника 5 марта 2015.
  39. ↑ (2002) «The geometry of domain combination in proteins». Journal of Molecular Biology 315 (4): 927–39. DOI:10.1006/jmbi.2001.5288. PMID 11812158.
  40. ↑ (2007) «The generation of new protein functions by the combination of domains». Structure 15 (1): 85–99. DOI:10.1016/j.str.2006.11.009. PMID 17223535.
  41. ↑ Bolser, Daniel Murray (2007), «The surfaces involved in the formation of protein complexes», University of Cambridge, <http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.612938> 
  42. ↑ Bremang, Michael Anthony (2012), «The mouse protein repertoire : studies on alternative splicing, function and quality», University of Cambridge, <http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.610626> 
  43. ↑ de Bono, Bernard (2004), «Immunoglobulin superfamily proteins in human and mouse», University of Cambridge, <http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.598443> 
  44. ↑ (2003) «Exegesis: a procedure to improve gene predictions and its use to find immunoglobulin superfamily proteins in the human and mouse genomes». Nucleic Acids Research 31 (21): 6096–6103. DOI:10.1093/nar/gkg828. PMID 14576296.
  45. ↑ Hill, Emma Elizabeth (2002), «Evolution of protein families: genome sequences and three dimensional structures», University of Cambridge, <http://ulmss-newton.lib.cam.ac.uk/vwebv/holdingsInfo?bibId=23724> 
  46. ↑ Emma Hill's Homepage. University of California, Berkeley. Архивировано из первоисточника 13 июля 2006.
  47. ↑ Emma Ganley (née Hill) PLOS staff. PLOS. Архивировано из первоисточника 24 апреля 2015.
  48. ↑ Madera, Martin (2005), «Hidden Markov models for detection of remote homology», University of Cambridge, <http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.615112> 
  49. ↑ (2004) «The SUPERFAMILY database in 2004: additions and improvements». Nucleic Acids Research 32 (90001): 235D–239. DOI:10.1093/nar/gkh117. PMID 14681402.
  50. ↑ Maslau, Siarhei (2007), «Formation of the small molecule metabolism of Escherichia coli», University of Cambridge, <http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.613391> 
  51. ↑ Miller, G. S. P. (1987), «Computer display and manufacture of 3-D models», University of Cambridge, OCLC 59769936, <http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.235044> 
  52. ↑ (1987) «Interior and surface of monomeric proteins». Journal of Molecular Biology 196 (3): 641–656. DOI:10.1016/0022-2836(87)90038-6. PMID 3681970.
  53. ↑ (1987) «The accessible surface area and stability of oligomeric proteins». Nature 328 (6133): 834–836. DOI:10.1038/328834a0. PMID 3627230. Bibcode: 1987Natur.328..834M.
  54. ↑ Park, Jong Hwa (1997), «Genome sequence analysis and methods», University of Cambridge, <http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.627329> 
  55. ↑ Шаблон:GoogleScholar
  56. ↑ Jong Bhak's home page: An entrepreneur and a scientist. jongbhak.com. Архивировано из первоисточника 20 декабря 2014.
  57. ↑ Sasidharan, Rajkumar (2004), «Protein evolution : the selection of acceptable mutations», University of Cambridge, <http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.616044> 
  58. ↑ (2007) «The selection of acceptable protein mutations». Proceedings of the National Academy of Sciences 104 (24): 10080–10085. DOI:10.1073/pnas.0703737104. PMID 17540730. Bibcode: 2007PNAS..10410080S.
  59. ↑ Vogel, Christine (2004), «A domain perspective on the evolution of the protein repertoire», University of Cambridge, <http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.616272> 
  60. ↑ (2006) «Protein Family Expansions and Biological Complexity». PLOS Computational Biology 2 (5): e48. DOI:10.1371/journal.pcbi.0020048. PMID 16733546. Bibcode: 2006PLSCB...2...48V. публикация в открытом доступе
  61. ↑ (2015) «Message from the ISCB: 2015 ISCB Accomplishment by a Senior Scientist Award: Cyrus Chothia». Bioinformatics 31 (13): 2238–9. DOI:10.1093/bioinformatics/btv218. PMID 26002905.
  62. ↑ Ошибка цитирования Неверный тег <ref>; для сносок iscb-award не указан текст
  63. ↑ Meet the ISCB Fellows Class of 2015. Архивировано из первоисточника 20 февраля 2015. Проверено 15 февраля 2015.
  64. ↑ Ошибка цитирования Неверный тег <ref>; для сносок dan-david-prize не указан текст
Рувики

Одним из источников, использованных при создании данной статьи, является статья из википроекта «Рувики» («ruwiki.ru») под названием «Чотиа, Сайрус», расположенная по адресу:

—https://ru.ruwiki.ru/wiki/Чотиа,_Сайрус

Материал указанной статьи полностью или частично использован в Циклопедии по лицензии CC-BY-SA 4.0 и более поздних версий.

Всем участникам Рувики предлагается прочитать материал «Почему Циклопедия?».

Источник — http://cyclowiki.org/w/index.php?title=Чотиа,_Сайрус&oldid=2004873