Хана Маргалит

Хана Маргалит

Место рождения

Израиль

Награды и премии

ISCB Fellow (2018), Landau Prize in Systems Biology (2008)

Хана Маргалит (англ. Hanah Margalit) — израильский биолог, профессор медицинского факультета Еврейского университета в Иерусалиме.

Биография

Получила степень бакалавра (по математике и биологии, 1974) и степень магистра (по генетике, с отличием, 1977) в Еврейском университете в Иерусалиме. В 1985 году получила докторскую степень в области вычислительной молекулярной биологии в Еврейском университете в Иерусалиме.

Закончила докторантуру в Национальном институте здоровья в лаборатории математической биологии под руководством Чарльза ДеЛизи, где разработала первый вычислительный алгоритм для прогнозирования антигенных пептидов, распознаваемых иммунными клетками.

В 1989 году вернулась в Израиль и создала свою исследовательскую группу на медицинском факультете Еврейского университета в Иерусалиме.

Ее ранние исследования включали разработку вычислительных алгоритмов для прогнозирования связывания антигенных пептидов с молекулами МНС, вычислительные модели предпочтений связывания белок-ДНК и т. д.

В 2002—2004 годах — президент Израильского общества биоинформатики и вычислительной биологии.

Её исследования включают биоинформатику, вычислительную биологию и системную биологию, особенно в области регуляции генов у бактерий и эукариот.

Со своим мужем Ави имеет троих детей.

Труды

• Margalit, H.; Spouge, J. L.; Cornette, J. L.; Cease, K. B.; Delisi, C.; Berzofsky, J. A. (1987). "Prediction of immunodominant helper T cell antigenic sites from the primary sequence". Journal of Immunology. 138 (7): 2213–2229.
• Altuvia, Y.; Schueler, O.; Margalit, H. (1995). "Ranking potential binding peptides to MHC molecules by a computational threading approach". Journal of Molecular Biology. 249 (2): 244–250.
• Mandel-Gutfreund, Y.; Schueler, O.; Margalit, H. (1995). "Comprehensive analysis of hydrogen bonds in regulatory protein DNA-complexes: in search of common principles". Journal of Molecular Biology. 253 (2): 370–382.
• Mandel-Gutfreund, Y.; Margalit, H. (1998). "Quantitative parameters for amino acid-base interaction: implications for prediction of protein-DNA binding sites". Nucleic Acids Research. 26 (10): 2306–2312.
• Kaplan, Tommy; Friedman, Nir; Margalit, Hanah (2005). "Ab Initio Prediction of Transcription Factor Targets Using Structural Knowledge". PLoS Computational Biology. 1 (1): e1.
• Sprinzak, E.; Margalit, H. (2001-08-24). "Correlated sequence-signatures as markers of protein-protein interaction". Journal of Molecular Biology. 311 (4): 681–692.
• Yeger-Lotem, Esti; Sattath, Shmuel; Kashtan, Nadav; Itzkovitz, Shalev; Milo, Ron; Pinter, Ron Y.; Alon, Uri; Margalit, Hanah (2004). "Network motifs in integrated cellular networks of transcription-regulation and protein-protein interaction". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 101 (16): 5934–5939.
• Argaman, L.; Hershberg, R.; Vogel, J.; Bejerano, G.; Wagner, E. G.; Margalit, H.; Altuvia, S. (2001-06-26). "Novel small RNA-encoding genes in the intergenic regions of Escherichia coli". Current Biology. 11 (12): 941–950.
• Shimoni, Yishai; Friedlander, Gilgi; Hetzroni, Guy; Niv, Gali; Altuvia, Shoshy; Biham, Ofer; Margalit, Hanah (2007). "Regulation of gene expression by small non-coding RNAs: a quantitative view". Molecular Systems Biology. 3: 138.
• Stern-Ginossar, Noam; Elefant, Naama; Zimmermann, Albert; Wolf, Dana G.; Saleh, Nivin; Biton, Moshe; Horwitz, Elad; Prokocimer, Zafnat; Prichard, Mark; Hahn, Gabriele; Goldman-Wohl, Debra; Hahn, Gabriele; Greenfield, Caryn; Yagel, Simcha; Hengel, Hartmut; Altuvia, Yael; Margalit, Hanah; Mandelboim, Ofer (2007). "Host immune system gene targeting by a viral miRNA". Science. 317 (5836): 376–381.
• Melamed, Sahar; Peer, Asaf; Faigenbaum-Romm, Raya; Gatt, Yair E.; Reiss, Niv; Bar, Amir; Altuvia, Yael; Argaman, Liron; Margalit, Hanah (2016). "Global Mapping of Small RNA-Target Interactions in Bacteria". Molecular Cell. 63 (5): 884–897.