Лиран Кармель

Лиран Кармель

Дата рождения

7 августа 1971 года

Место рождения

Израиль

Лиран Кармель (англ. Liran Carmel, ивр. לירן כרמל) — израильский ученый, заведующий кафедры генетики, профессор вычислительной биологии Еврейского университета в Иерусалиме.

Биография

Родился 7 августа 1971 года.

В рамках Академического резерва получал высшее образование (получил степень бакалавра по физике в Тель-Авивском университете) и работал в Rafael.

Затем получил степень магистра в области квантовой механики в Технионе и докторскую степень по математике и информатике в Институте Вейцмана (научный руководитель — Давид Харель). В своей докторской диссертации Кармель разработал алгоритмы кодирования и оцифровки запаха и возглавлял команду алгоритмов в компании, которая разрабатывала средства для компьютерной передачи запаха. В 2004 году Кармель отправился в США для получения докторской степени в Национальном институте здравоохранения в Бетесде, штат Мэриленд, где он специализировался на молекулярной эволюции в исследовательской группе Евгения (Юджина) Викторовича Кунина, крупного американского биолога российского происхождения.

Вернувшись в Израиль в 2008 году создал исследовательскую группу по вычислительной биологии на кафедре генетики Института биологических наук имени Александра Зильбермана Еврейского университета в Иерусалиме.

В 2016 году был приглашен в качестве старшего приглашенного профессора в Университет Нового Южного Уэльса в Сиднее, Австралия, где провёл год.

Женат Анат Гилад-Кармель, у пары трое детей, семья живёт в Шохаме.

Вклад в науку

Области исследований: вычислительная молекулярная эволюция, эволюция человека и древней ДНК. Опубликовал десятки научных работ в этих областях.

В 2014 году вместе с профессором Эраном Мешорером разработал вычислительную технику для реконструкции общегеномных карт метилирования ДНК (ключевого эпигенетического механизма) из древних последовательностей ДНК. Кармель использовал эту технику к древней ДНК неандертальцев и денисовцев и, тем самым, стал первым, кто восстановил эпигенетические закономерности архаичных людей и идентифицировал гены, которые дифференцированно метилируются между архаичными и современными людьми. Эти гены включают многие из тех, которые экспрессируются в головном мозге и связаны с неврологическими расстройствами (болезнь Альцгеймера, аутизм, шизофрения).

В 2017 году Кармель разработал инструмент, который идентифицирует органы и части тела, которые предпочтительно обогащены набором генов. Данный инструмент помогает понять, как на организм человека влияют изменения в уровнях экспрессии генов. Сочетая этот инструмент со своими исследованиями паттернов метилирования ДНК у архаичных людей, Кармель совместно с профессором Эраном Мешорером показал в 2020 году, что голосовая и лицевая анатомия современных людей отличается от анатомии неандертальцев и денисовцев, фиксируя эволюционные процессы за последние сотни тысяч лет, которые повлияли на голосовую связку современного человека.

В 2019 году группа учёных во главе с исследователями Еврейского университета в Иерусалиме профессором Лираном Кармелем и доктором Дэвидом Гохманом осуществила реконструкцию внешности «денисовцев» на основе моделей метилирования (химических изменений) в их древней ДНК. «Мы совершили первую в мире реконструкцию скелетной анатомии денисовского человека», — отмечал ведущий автор исследования Лиран Кармель, профессор Института естественных наук Еврейского Университета. «Во многих отношениях денисовцы напоминали неандертальцев, но по некоторым признакам они напоминали нас, а по другим они были совершенно уникальны».

В 2020 году Кармель опубликовал исследование по генетике ханаанцев. В этой работе он секвенировал ДНК десятков ханаанских людей, которые жили в Южном Леванте в эпоху бронзы, в таких местах, как Мегиддо и Хазор. В итоге учёный выявил частичное происхождение хананеев от жителей Закавказья, что согласуется с известным фактом переселения хурритов в Ханаан (см. Хурриты и евреи).

Труды

• Gokhman, David; Lavi, Eitan; Prüfer, Kay; Fraga, Mario F.; Riancho, José A.; Kelso, Janet; Pääbo, Svante; Meshorer, Eran; Carmel, Liran (2 May 2014). «Reconstructing the DNA Methylation Maps of the Neandertal and the Denisovan». Science. 344 (6183): 523—527.
• Gokhman, David; Kelman, Guy; Amartely, Adir; Gershon, Guy; Tsur, Shira; Carmel, Liran (21 April 2017). «Gene ORGANizer: linking genes to the organs they affect». Nucleic Acids Research. 45 (W1): W138-W145.
• Gokhman, David; Nissim-Rafinia, Malka; Agranat-Tamir, Lily; Housman, Genevieve; García-Pérez, Raquel; Lizano, Esther; Cheronet, Olivia; Mallick, Swapan; Nieves-Colón, Maria A.; Li, Heng; Alpaslan-Roodenberg, Songül; Novak, Mario; Gu, Hongcang; Osinski, Jason M.; Ferrando-Bernal, Manuel; Gelabert, Pere; Lipende, Iddi; Mjungu, Deus; Kondova, Ivanela; Bontrop, Ronald; Kullmer, Ottmar; Weber, Gerhard; Shahar, Tal; Dvir-Ginzberg, Mona; Faerman, Marina; Quillen, Ellen E.; Meissner, Alexander; Lahav, Yonatan; Kandel, Leonid; Liebergall, Meir; Prada, María E.; Vidal, Julio M.; Gronostajski, Richard M.; Stone, Anne C.; Yakir, Benjamin; Lalueza-Fox, Carles; Pinhasi, Ron; Reich, David; Marques-Bonet, Tomas; Meshorer, Eran; Carmel, Liran (4 March 2020). «Differential DNA methylation of vocal and facial anatomy genes in modern humans». Nature Communications. 11 (1): 1189.
• Gokhman, David; Mishol, Nadav; Manuel, Marc de; Juan, David de; Shuqrun, Jonathan; Meshorer, Eran; Marques-Bonet, Tomas; Rak, Yoel; Carmel, Liran (19 September 2019). «Reconstructing Denisovan Anatomy Using DNA Methylation Maps». Cell. 179 (1): 180—192.e10.
• Agranat-Tamir, Lily; Waldman, Shamam; Rosen, Naomi; Yakir, Benjamin; Carmi, Shai; Carmel, Liran (11 December 2021). «LINADMIX: evaluating the effect of ancient admixture events on modern populations». Bioinformatics. 37 (24): 4744-4755.

Источники

Одним из источников этой статьи является статья в энциклопедии «Традиция», называющаяся «Лиран Кармель». Материал указанной статьи полностью или частично использован в Циклопедии по лицензии GNU FDL.