Циклопедия:Списки:Медицинское ПО с открытым исходным кодом

Общественное здравоохранение и наблюдение

• Epi Info — открытое статистическое программное обеспечение для эпидемиологии, разработанное Центрами по контролю и профилактике заболеваний США.

• Spatiotemporal Epidemiological Modeler это инструмент, первоначально разработанный в IBM Research для моделирования и визуализации распространения инфекционных заболеваний. Он поддерживается фондом Eclipse и доступен на условиях общественной лицензии Eclipse.

Электронный документооборот и управление медицинской практикой

Название	Сопровождение	Лицензия	Язык программирования/ Список решений	Операционная система	Характеристики				Предназначение
					EHR/EMR(ЭМК)	МИС?	Управление практикой?	Другое
ClearHealth	ClearHealth Inc.	GNU GPL	PHP, JavaScript		EMR		Расписания и платежи	Защищено актом HIPAA (США)
CottageMed		GNU GPL	FileMaker	Кроссплатформенное	EMR			Прописанные рецепты
FreeMED	FreeMED Software Foundation	GNU GPL						Защищено актом HIPAA (США)
FreeMedForms EMR		Debian совм.		Кроссплатформенное	EMR			Медицинский программный пакет	Международное
ERPNext	Frappe Technologies	GNU GPL	Python; JavaScript		EMR
GaiaEHR		GNU GPL	PHP & Ext JS		EHR
GNUmed	GNUmed	GNU GPL	Python (wxPython); PostgreSQL	Кроссплатформенное
GNU Health	GNU Health (GNU Project)	GNU GPL	Python (wxPython); PostgreSQL	Кроссплатформенное	EMR
Hospital OS		GNU GPL	Java	Linux & Windows					Маленькие больницы в Таиланде
HospitalRun		GNU GPL	JavaScript		EMR			Приоритет оффлайну	Больницы в развивающихся странах
HOSxP		Общественное достояние	Delphi/Kylix	Windows	EHR		Финансы		больницы в Таиланде
MedinTux	MedinTux team	CeCILL	C++	Кроссплатформенное				Модульное; Веб и настольные(desktop) приложения	Больницы вo Франции, ОРИТ и мелкие практики
Medkey	Medkey Ltd	беспл.	PHP7, JavaScript (Backbone, React), PostgreSQL, RabbitMQ	Кроссплатформенное					Частные и общественные амбулатории
Odoo Medical	LasLabs & Odoo Community Association	Affero GPL	Odoo						Семейный врач и первичная медицинская помощь
OpenClinic		GNU GPL	PHP, JavaScript	Кроссплатформенное	EMR				Частные клиники
OpenEMR		GNU GPL	PHP, JavaScript; MySQL	Кроссплатформенное	EMR			Портал для пациентов, предписания, рецепты
Open-eObs	OpusVL	GNU AGPL	Odoo; Python, JavaScript	Кроссплатформенное	Интегрировано с HL7, связь с системами приёма, выгрузки и передачи	на уровне палат		Просмотр пациентов в реальном времени и быстрая оценка состояния по NEWS / NEWS2 (брит.)	Национальная служба здравоохранения Великобритании
Open Dental	Open Dental Software	GNU GPL			Dental record				Стоматология
OpenEyes		GNU GPL			EMR				Офтальмология
OpenHospital	Informatici Senza Frontiere	GNU GPL	Java	Кроссплатформенное	EMR				Маленькие сельские больницы
openMAXIMS		GNU AGPL				Система администрации пациентов		Масштабируемая	Национальная служба здравоохранения Великобритании
OpenMRS	OpenMRS Inc.	MPL с отказом от мед. ответственности	Java		EMR			Расширяемая и масштабируемая
OSCAR McMaster		GNU GPL	Java		EMR		Счета	Веб-приложение; Персональная электронная карта здоровья (ПЭКЗ)	Услуги здравоохранения в Канаде
OSEHRA VistA	OSEHRA	Apache			EHR				Для частных учереждений
PopHealth	OSEHRA	беспл. Apache			Отчёты			БД клинических оценок качества; Веб-приложение
Ripple	Ripple Foundation	беспл. Apache	JavaScript (Node.js)					Интегрированная платформа для мед. данных	Национальная служба здравоохранения Великобритании
SMART Pediatric Growth Chart	Детская больница г. Бостон (США)	беспл. Apache	JavaScript		Диаграммы роста			Основано на стандарте FHIR	Педиатрия
Spinnaker	Dental IT Ltd	GNU GPL			Стоматологический анамнез			ответвление (Форк) от Open Dental	Стоматология в Великобритании
THIRRA		MPL	PHP5 (CodeIgniter), JavaScript (jQuery); PostgreSQL		EHR			Эпидемиология; Веб-приложение	Амбулаторное лечение & общественное здоровье
VistA (рус.)	Министерство по делам ветеранов США	беспл.			EHR				Медицинские учреждения для ветеранов в США
WorldVistA	WorldVistA	GNU GPL			EHR		с PMS VistA-Edge		Для частных учереждений
ZEPRS Zcore	Research Triangle Institute	беспл. Apache	Java					Веб-приложение

Управление системами здравоохранения

• iHRIS — это интегрированная ИС управления персоналом, разработанная IntraHealth International в рамках финансируемого агентством USAID проекта CapacityPlus, развёрнутая более чем в 20 странах мира. iHRIS распространяется по лицензии GNU GPL.
• DHIS является региональной ИС для управления здравоохранением и хранилищем данных. DHIS2 выпускается по лицензии BSD.
• HRHIS — ИС для здравоохранения по управлению персоналом, разработанная в Университете Дар-эс-Салама в колледже информационных и коммуникационных технологий, факультет компьютерных наук и инженерии, для Министерства здравоохранения и социального обеспечения (Танзании). Финансируется Японским агентством международного сотрудничества (JICA).^{[цитата не приведена 2957 дней]}

Управление течением болезни

• Breathing Games — серия совместно созданных игр для профилактики, диагностики и лечения хронических респираторных заболеваний. Они выпущены по лицензии Peer Production.
• Nightscout — это набор программных инструментов, в том числе мобильных клиентов, для самостоятельного создания облачных инструментов мониторинга глюкозы «…с образовательной целью.» Отдельные компоненты доступны по лицензиям с открытым исходным кодом, в том числе GNU GPL, GNU AGPL, лицензии MIT, и лицензии BSDs.

Изображения/Визуализация

• CamBA — это набор конвейеров (pipelines) для нейровизуализации распространяемых по лицензии GNU GPL.
• dcm4che — это набор Java приложений, поддерживающих стандарт DICOM для предприятий здравоохранения. Лицензируется в соответствии с GNU LGPL, GNU GPL и общественной лицензией Mozilla.
• Drishti — это пакет объемной визуализации для просмотра данных компьютерной томографии. Имеется возможность импортировать стеки изображений DICOM. Он доступен по лицензии MIT.
• Endrov — просмотр и редактирование изображений и данных. Доступно по лицензии BSD.
• GIMIAS — ориентированная на процесс рабочая среда. Пакет специализируется на вычислениях и моделировании биомедицинских изображений. Доступен по лицензии в стиле BSD.
• Ginkgo CADx Кроссплатформенное ПО для просмотра и перевода в формат DICOM. Доступно по лицензии GNU LGPL.
• Horos — это ПО для просмотра медицинских изображений DICOM. Доступно по лицензии GNU LGPL.
• ImageVis3D — ПО для объёмного рендеринга и интерактивной визуализация/визуализации. Доступно по лицензии MIT.
• Insight Segmentation and Registration Toolkit (ITK) v4.0+ выпускается по лицензии Apache.
• InVesalius — ПО для генерации визуализаций трёхмерных медицинских реконструкций. Доступно по лицензии GNU GPL.
• ITK-SNAP — интерактивное программное обеспечение для навигации по 3D-изображениям, аннотаций и автоматической сегментации. Доступно по лицензии GNU GPL.
• MITK (Medical Imaging Interaction Toolkit) — инструментарий для интерактивной обработки мед. изображений. Доступен по лицензии в стиле BSD.
• Orthanc — легкий, DICOM-сервер с архитектурой REST для мед. визуализации. Доступен по лицензии GNU GPL за исключением OpenSSL; Плагины могут быть выпущены по другим лицензиям.
• OsiriX — 3D DICOM изображения для Mac OS X. Полноценный просмотр DICOM с поддержкой DICOM сети.^{[цитата не приведена 2927 дней]}
• ParaView(рус.) — масштабный инструмент для визуализации. Доступен по лицензии BSD.
• 3DSlicer — платформа для визуализации медицинских изображений и разработки алгоритмов. Поддержка DICOM, сегментация, регистрация, обработка диффузионных МРТ и поддержка технологии хирургии по изображению. Доступна по лицензии в стиле BSD.
• Voreen система визуализации объёмных (3D) данных — библиотека для визуального изучения объёмных наборов данных. Поддержка DICOМ. Voreen используется для визуализации мед. изображений, а также данных электронной микроскопии. Доступно по лицензии GNU GPL.
• VTK(рус.) — это набор инструментов для визуализации, доступный по лицензии BSD.
• Xebra — это тонкий клиент для мед. визуализации, доступный по лицензии GNU GPL.

Медицинские информационные системы

• Caisis — это сетевая информационная система для хранения и анализа данных о раковых пациентах, предназначенная для уменьшения разрыва между амбулаторией и исследованиями. Доступна по лицензии GNU GPL.
• cTAKES ( 'ПО для извлечения знаний при помощи анализа клинических текстов' ) — это система обработки естественного языка для извлечения информации из электронных медицинских записей и медицинских текстов. С 2013 года это проект высшего уровня (TLP) фонда Apache, разработанный клиникой Майo и др. Доступно по лицензии Apache.

Исследования

• ADAM — это аналитическая платформа для геномики с акцентом на масштабируемость и функциональную совместимость. Доступно по лицензии Apache.
• Bcbio — это разработанная на общественных началах система геномики для обработки данных во время секвенирования. Доступно по лицензии MIT.
• Galaxy — веб- платформа для задач биологии по обработке большого объёма данных, использующая географически распределенные суперкомпьютеры.
• i2b2 — это финансируемый национальными институтами здравоохранения США фреймворк информатики для исследователей геномики в клиниках. Он доступен по лицензии на программное обеспечение i2b2.
• LabKey Server — расширяемая платформа для интеграции, анализа и передачи всех типов данных для биомедицинских исследований. Сервер обеспечивает безопасный доступ к исследовательским данным через веб-интерфейс, а также содержит настраиваемый конвейер обработки данных. Распространяется по лицензии Apache.
• Open cancer — это система управления данными о раке, целью которой является предоставление открытых моделей данных, клинических путей, прогностической оценки и авто-идентификации исследуемых пациентов. ^{[цитата не приведена 2927 дней]}
• Wregex — это ПО для поиска аминокислотных мотивов с использованием взвешенных регулярных выражений. ПО доступно по лицензии GNU GPL.
• Phoenix CTMS является интегрированной системой управления клиническими исследованиями и платформой для реестра субъектов, доступной по лицензии LGPL.

Мобильные устройства

• Glucosio позволяет людям с диабетом отслеживать свой уровень глюкозы, при этом поддерживая исследования диабета через мобильные приложения на Android или iOS. Приложения выпущены по лицензии GNU GPL.
• Medic Mobile(рус.) сочетает в себе обмен сообщениями SMS, сбор данных и аналитику для работников и систем здравоохранения в труднодоступных районах с подключением к Интернету или без него. Веб-приложение доступно по лицензии Apache.
• OpenAPS представляет собой набор документации и инструментов разработки для самостоятельной реализации технологии искусственной поджелудочной железы для людей с диабетом 1-го типа. Обычно содержит интерфейсы для цифровых глюкометров, инсулиновых помп и Raspberry Pi. Выпускается по лицензии MIT, но совместимые мед. устройства могут требовать приобретения прав.
• Ушахиди(рус.) позволяет людям уведомлять о кризисных состояниях через текстовые сообщения, используя мобильный телефон, электронную почту или веб-форму. Отображает информацию на карте. Выпускается по лицензии GNU Affero GPL], но некоторые библиотеки используют другие лицензии.

Дистрибутивы из коробки

• BioLinux
• Debian-Med — версия Debian Pure Blend для использования в медицинских и биомедицинских условиях.
• Ubuntu-Med

Совместимость

• Cypress поддерживается корпорацией MITRE и финансируется центрами Medicaid и Офисом нац. координатора по ИТ в здравоохранении США (ONC). Используется для тестирования EHR ПО на соответствие значимым показателям качества клинического использования (ур. 2). Cypress распространяется по лицензии Apache.
• Laika была разработана Комиссией по сертификации информационных технологий здравоохранения (CCHIT) и корпорацией MITRE для тестирования EHR ПО на соответствие требованиям совместимости стандартам данных CCHIT, включая лабораторные сообщения HL7 v2 и HITSP C32 XML. Laika доступна по лицензии Apache.
• Mirth — это кроссплатформенная библиотека для работы с HL7, которая обеспечивает отправку и приём сообщений HL7 между системами и приложениями различными системами связи. Доступна в соответствии с общественной лицензией Mozilla.

Спецификации

• стандарт CCD (Continuity of Care Document) — стандарт преемственности медицинских документов.
• Fast Healthcare Interoperability Resources (FHIR) — спецификация совместимости HL7, которая определяет форматы данных JSON и XML и RESTful API. Доступна по лицензии CC0.
• openEHR — это открытая спецификация стандарта EHR в области информатики здравоохранения. Описывает управление, хранение, поиск и обмен данными о состоянии здоровья в электронных записях о состоянии здоровья (EHR) в соответствии с двухуровневой парадигмой моделирования. Базовая спецификация OpenEHR доступна в соответствии с лицензией «Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 Unported».

См. также

• Электронная медицинская карта
• Медицинская информационная система
• Медицинская кибернетика
• Телемедицина
• HL7

Ссылки

• Medical Free/Libre and Open Source Software. рабочая группа по открытому коду Международной ассоциации по медицинской информатике (IMIA). Проверено 3 июля 2017.
• (4 июля 2012) «Электронные медицинские записи с открытым исходным кодом для использования в условиях ограниченных ресурсов: систематический обзор и анкетирование». BMJ Open 2 (4). DOI:10.1136/bmjopen-2011-000690. PMID 22763661.